Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDC23Q9UJX2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC23Q9UJX2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms