Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA3

MCM8, DNA helicase MCM8, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM8Q9UJA3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCM8Q9UJA3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms