Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
SMPXQ9UHP9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMPXQ9UHP9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms