Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX25Q9UHL0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX25Q9UHL0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms