Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMGXB4Q9UGU5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMGXB4Q9UGU5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms