Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF1

MAGEC2, Melanoma-associated antigen C2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEC2Q9UBF1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAGEC2Q9UBF1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAGEC2Q9UBF1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAGEC2Q9UBF1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAGEC2Q9UBF1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MAGEC2Q9UBF1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAGEC2Q9UBF1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAGEC2Q9UBF1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAGEC2Q9UBF1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAGEC2Q9UBF1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAGEC2Q9UBF1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAGEC2Q9UBF1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAGEC2Q9UBF1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAGEC2Q9UBF1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAGEC2Q9UBF1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAGEC2Q9UBF1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAGEC2Q9UBF1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAGEC2Q9UBF1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAGEC2Q9UBF1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAGEC2Q9UBF1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAGEC2Q9UBF1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAGEC2Q9UBF1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAGEC2Q9UBF1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAGEC2Q9UBF1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAGEC2Q9UBF1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAGEC2Q9UBF1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAGEC2Q9UBF1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAGEC2Q9UBF1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAGEC2Q9UBF1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAGEC2Q9UBF1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MAGEC2Q9UBF1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAGEC2Q9UBF1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms