Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC5

MYO1A, Unconventional myosin-Ia, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1AQ9UBC5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MYO1AQ9UBC5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYO1AQ9UBC5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms