Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNMT3BQ9UBC3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DNMT3BQ9UBC3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DNMT3BQ9UBC3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms