Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL9Q9P2J3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL9Q9P2J3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms