Protein–RNA interactions for Protein: Q9P253

VPS18, Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS18Q9P253 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS18Q9P253 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS18Q9P253 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms