Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CALCOCO1Q9P1Z2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALCOCO1Q9P1Z2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms