Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNRD1Q9P1U0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRD1Q9P1U0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms