Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2L1Q9P0L9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD2L1Q9P0L9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms