Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMOD2Q9NZR1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMOD2Q9NZR1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
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