Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NLGN3Q9NZ94 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NLGN3Q9NZ94 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms