Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GGA3Q9NZ52 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GGA3Q9NZ52 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GGA3Q9NZ52 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms