Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM53CQ9NYF3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM53CQ9NYF3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FAM53CQ9NYF3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms