Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKN2AIPQ9NXV6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN2AIPQ9NXV6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN2AIPQ9NXV6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN2AIPQ9NXV6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN2AIPQ9NXV6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN2AIPQ9NXV6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN2AIPQ9NXV6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN2AIPQ9NXV6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN2AIPQ9NXV6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN2AIPQ9NXV6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN2AIPQ9NXV6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN2AIPQ9NXV6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN2AIPQ9NXV6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN2AIPQ9NXV6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKN2AIPQ9NXV6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKN2AIPQ9NXV6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKN2AIPQ9NXV6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKN2AIPQ9NXV6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKN2AIPQ9NXV6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKN2AIPQ9NXV6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKN2AIPQ9NXV6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKN2AIPQ9NXV6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKN2AIPQ9NXV6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKN2AIPQ9NXV6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKN2AIPQ9NXV6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKN2AIPQ9NXV6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKN2AIPQ9NXV6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKN2AIPQ9NXV6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKN2AIPQ9NXV6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKN2AIPQ9NXV6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKN2AIPQ9NXV6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKN2AIPQ9NXV6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKN2AIPQ9NXV6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKN2AIPQ9NXV6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms