Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV2

KCTD5, BTB/POZ domain-containing protein KCTD5, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD5Q9NXV2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD5Q9NXV2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD5Q9NXV2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms