Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GIN1Q9NXP7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GIN1Q9NXP7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms