Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVK13-1Q9NX77 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVK13-1Q9NX77 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms