Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX07

TRNAU1AP, tRNA selenocysteine 1-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNAU1APQ9NX07 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRNAU1APQ9NX07 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRNAU1APQ9NX07 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRNAU1APQ9NX07 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms