Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV88

INTS9, Integrator complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS9Q9NV88 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
INTS9Q9NV88 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INTS9Q9NV88 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms