Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPTLC3Q9NUV7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPTLC3Q9NUV7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms