Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCM2LQ9NUG4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCM2LQ9NUG4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms