Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTN9

SEMA4G, Semaphorin-4G, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4GQ9NTN9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4GQ9NTN9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4GQ9NTN9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4GQ9NTN9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4GQ9NTN9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms