Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
PDS5BQ9NTI5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC39.03■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
PDS5BQ9NTI5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC39■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC39■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC39■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC38.97■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC38.96■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
PDS5BQ9NTI5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
PDS5BQ9NTI5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC38.94■■■■□ 3.82
PDS5BQ9NTI5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
PDS5BQ9NTI5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
PDS5BQ9NTI5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
PDS5BQ9NTI5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
PDS5BQ9NTI5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC38.93■■■■□ 3.82
PDS5BQ9NTI5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
PDS5BQ9NTI5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms