Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 RPL17-224ENST00000618619 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.564e-19■□□□□ 10.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPL17-222ENST00000617346 795 ntTSL 511.48□□□□□ -0.574e-19■□□□□ 10.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPL17-211ENST00000581305 593 ntTSL 510.49□□□□□ -0.734e-19■□□□□ 10.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPL17-212ENST00000581373 584 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.894e-19■□□□□ 10.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPL17-208ENST00000580261 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.194e-19■□□□□ 10.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPL17-217ENST00000583036 576 ntTSL 36.71□□□□□ -1.344e-19■□□□□ 10.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPL17-215ENST00000582782 562 ntTSL 33.65□□□□□ -1.834e-19■□□□□ 10.7
APOBEC3CQ9NRW3 RPL17-203ENST00000578966 563 ntTSL 1 (best)2.73□□□□□ -1.974e-19■□□□□ 10.7
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.374e-16■□□□□ 10.7
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5B-204ENST00000548474 449 ntTSL 36.75□□□□□ -1.334e-16■□□□□ 10.7
APOBEC3CQ9NRW3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.582e-9■□□□□ 10.7
APOBEC3CQ9NRW3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.462e-9■□□□□ 10.7
APOBEC3CQ9NRW3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.122e-9■□□□□ 10.7
APOBEC3CQ9NRW3 PTOV1-209ENST00000597793 1716 ntTSL 1 (best)20.6■□□□□ 0.892e-9■□□□□ 10.7
APOBEC3CQ9NRW3 CIZ1-220ENST00000485862 843 ntTSL 217.5■□□□□ 0.392e-9■□□□□ 10.7
APOBEC3CQ9NRW3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.332e-9■□□□□ 10.7
APOBEC3CQ9NRW3 PTOV1-208ENST00000597730 327 ntTSL 217■□□□□ 0.312e-9■□□□□ 10.7
APOBEC3CQ9NRW3 PTOV1-210ENST00000598325 1438 ntTSL 516.36■□□□□ 0.212e-9■□□□□ 10.7
APOBEC3CQ9NRW3 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.122e-9■□□□□ 10.7
APOBEC3CQ9NRW3 PTOV1-218ENST00000601612 1480 ntTSL 214.53□□□□□ -0.082e-9■□□□□ 10.7
APOBEC3CQ9NRW3 PTOV1-216ENST00000601093 522 ntTSL 212.62□□□□□ -0.392e-9■□□□□ 10.7
APOBEC3CQ9NRW3 CIZ1-210ENST00000461765 677 ntTSL 39.35□□□□□ -0.912e-9■□□□□ 10.7
APOBEC3CQ9NRW3 TIMP1-201ENST00000218388 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.154e-7■□□□□ 10.7
APOBEC3CQ9NRW3 TIMP1-202ENST00000377017 626 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.154e-7■□□□□ 10.7
APOBEC3CQ9NRW3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.462e-7■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.382e-7■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 ANP32A-201ENST00000267918 1084 ntTSL 316.3■□□□□ 0.22e-7■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.192e-7■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 ANP32A-207ENST00000486054 2015 ntTSL 215.51■□□□□ 0.072e-7■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 ANP32A-202ENST00000409628 2001 ntTSL 514.68□□□□□ -0.062e-7■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.352e-7■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 EIF5-205ENST00000558506 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.362e-7■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 ANP32A-206ENST00000483551 3711 ntTSL 58.83□□□□□ -12e-7■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 EIF5-220ENST00000561406 384 ntTSL 36.16□□□□□ -1.422e-7■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 EIF5-207ENST00000558800 552 ntTSL 23.06□□□□□ -1.922e-7■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.232e-17■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 GSTP1-205ENST00000494593 1681 ntTSL 220.8■□□□□ 0.922e-17■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.072e-17■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 GSTP1-207ENST00000498765 723 ntTSL 310.57□□□□□ -0.722e-17■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 UBL5-204ENST00000588595 546 ntTSL 222.77■■□□□ 1.241e-6■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.264e-8■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 COX7B-201ENST00000373335 497 ntTSL 22.29□□□□□ -2.044e-8■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 LGALS1-205ENST00000472321 546 ntTSL 220.47■□□□□ 0.872e-10■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 LGALS1-207ENST00000489315 516 ntTSL 320.47■□□□□ 0.872e-10■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.921e-8■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.771e-8■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.551e-8■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.151e-8■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.171e-8■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.817e-12■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5L-204ENST00000529460 457 ntTSL 312.03□□□□□ -0.487e-12■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5L-207ENST00000533172 336 ntTSL 211.13□□□□□ -0.637e-12■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5L-202ENST00000524422 720 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.97e-12■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5L-205ENST00000529770 575 ntTSL 26.67□□□□□ -1.347e-12■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5L-206ENST00000529790 900 ntTSL 26.57□□□□□ -1.367e-12■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5L-203ENST00000527186 1582 ntTSL 24.71□□□□□ -1.667e-12■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 LGALS1-202ENST00000425542 637 ntTSL 320.47■□□□□ 0.872e-10■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.722e-10■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 LGALS1-203ENST00000454173 331 ntTSL 516.21■□□□□ 0.192e-10■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 LDHA-222ENST00000543695 554 ntTSL 511.2□□□□□ -0.627e-11■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 COX6B1-201ENST00000246554 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.295e-7■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 SNHG5-215ENST00000623163 851 ntTSL 516.01■□□□□ 0.152e-8■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 SNHG5-209ENST00000435947 696 ntTSL 215.27■□□□□ 0.042e-8■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 SNHG5-206ENST00000428833 641 ntTSL 213.43□□□□□ -0.262e-8■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 SNHG5-210ENST00000453754 401 ntTSL 313.43□□□□□ -0.262e-8■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 SNHG5-220ENST00000624128 672 ntTSL 29.36□□□□□ -0.912e-8■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 SNHG5-218ENST00000623901 711 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.992e-8■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 SNHG5-217ENST00000623650 886 ntTSL 58.62□□□□□ -1.032e-8■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.312e-8■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.472e-8■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 SNHG5-216ENST00000623267 374 ntTSL 55.85□□□□□ -1.472e-8■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 SNHG5-204ENST00000425170 489 ntTSL 24.62□□□□□ -1.672e-8■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.772e-8■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 SNHG5-208ENST00000433843 388 ntTSL 21.62□□□□□ -2.152e-8■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.022e-6■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 XPO1-206ENST00000428210 6776 ntTSL 213.48□□□□□ -0.252e-6■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.672e-6■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 HSPD1-201ENST00000345042 2299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.332e-6■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 PPIH-205ENST00000440068 669 ntTSL 514.99□□□□□ -0.011e-6■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 PPIH-203ENST00000372550 665 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.91e-6■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 PPIH-201ENST00000304979 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.981e-6■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 PPIH-206ENST00000461351 527 ntTSL 37.02□□□□□ -1.291e-6■□□□□ 10.6
APOBEC3CQ9NRW3 SNRPG-207ENST00000480370 487 ntTSL 212.29□□□□□ -0.442e-6■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 SNRPG-203ENST00000429728 566 ntTSL 210.08□□□□□ -0.82e-6■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 SNRPG-201ENST00000272348 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.982e-6■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 SNRPG-209ENST00000488400 393 ntTSL 28.29□□□□□ -1.082e-6■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.922e-6■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 FLNA-217ENST00000498411 368 ntTSL 315.96■□□□□ 0.159e-7■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.29e-7■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 FLNA-206ENST00000420627 8225 ntTSL 512.96□□□□□ -0.339e-7■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.439e-7■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.519e-7■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.569e-7■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 TIMP1-204ENST00000445623 595 ntTSL 214.09□□□□□ -0.154e-18■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.182e-12■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 CALR-203ENST00000586803 667 ntTSL 214.55□□□□□ -0.082e-12■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 CALR-202ENST00000586760 913 ntTSL 213.16□□□□□ -0.32e-12■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5J2-212ENST00000524321 584 ntTSL 212.63□□□□□ -0.392e-8■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5J2-208ENST00000485011 597 ntTSL 211.23□□□□□ -0.612e-8■□□□□ 10.5
APOBEC3CQ9NRW3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.676e-8■□□□□ 10.5
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