Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNNM1Q9NRU3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CNNM1Q9NRU3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms