Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR3

CDC42SE2, CDC42 small effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42SE2Q9NRR3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC42SE2Q9NRR3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42SE2Q9NRR3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms