Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
ASCL3Q9NQ33 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ASCL3Q9NQ33 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ASCL3Q9NQ33 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms