Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDH12Q9NPG4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDH12Q9NPG4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDH12Q9NPG4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms