Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP50

FAM60A, Protein FAM60A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM60AQ9NP50 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM60AQ9NP50 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM60AQ9NP50 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM60AQ9NP50 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM60AQ9NP50 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM60AQ9NP50 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM60AQ9NP50 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM60AQ9NP50 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM60AQ9NP50 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM60AQ9NP50 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM60AQ9NP50 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM60AQ9NP50 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM60AQ9NP50 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM60AQ9NP50 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM60AQ9NP50 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM60AQ9NP50 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM60AQ9NP50 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM60AQ9NP50 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM60AQ9NP50 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM60AQ9NP50 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM60AQ9NP50 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM60AQ9NP50 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM60AQ9NP50 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM60AQ9NP50 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM60AQ9NP50 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM60AQ9NP50 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM60AQ9NP50 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM60AQ9NP50 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM60AQ9NP50 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM60AQ9NP50 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM60AQ9NP50 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM60AQ9NP50 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM60AQ9NP50 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM60AQ9NP50 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM60AQ9NP50 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms