Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU9

POPDC2, Popeye domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC2Q9HBU9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POPDC2Q9HBU9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POPDC2Q9HBU9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms