Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q4

NHEJ1, Non-homologous end-joining factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NHEJ1Q9H9Q4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NHEJ1Q9H9Q4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms