Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVMER34-1Q9H9K5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVMER34-1Q9H9K5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms