Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9J2

MRPL44, 39S ribosomal protein L44, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL44Q9H9J2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MRPL44Q9H9J2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPL44Q9H9J2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms