Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6L5

RETREG1, Reticulophagy regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG1Q9H6L5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RETREG1Q9H6L5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RETREG1Q9H6L5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms