Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4M3

FBXO44, F-box only protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO44Q9H4M3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO44Q9H4M3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO44Q9H4M3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO44Q9H4M3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO44Q9H4M3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO44Q9H4M3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO44Q9H4M3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO44Q9H4M3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO44Q9H4M3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO44Q9H4M3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO44Q9H4M3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO44Q9H4M3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO44Q9H4M3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO44Q9H4M3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO44Q9H4M3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO44Q9H4M3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO44Q9H4M3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO44Q9H4M3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO44Q9H4M3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO44Q9H4M3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO44Q9H4M3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO44Q9H4M3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO44Q9H4M3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO44Q9H4M3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO44Q9H4M3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO44Q9H4M3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO44Q9H4M3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms