Protein–RNA interactions for Protein: Q9H446

RWDD1, RWD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD1Q9H446 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RWDD1Q9H446 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RWDD1Q9H446 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RWDD1Q9H446 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RWDD1Q9H446 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RWDD1Q9H446 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RWDD1Q9H446 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RWDD1Q9H446 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RWDD1Q9H446 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RWDD1Q9H446 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RWDD1Q9H446 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RWDD1Q9H446 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RWDD1Q9H446 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RWDD1Q9H446 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RWDD1Q9H446 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RWDD1Q9H446 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RWDD1Q9H446 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RWDD1Q9H446 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RWDD1Q9H446 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RWDD1Q9H446 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RWDD1Q9H446 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RWDD1Q9H446 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RWDD1Q9H446 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RWDD1Q9H446 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RWDD1Q9H446 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RWDD1Q9H446 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RWDD1Q9H446 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RWDD1Q9H446 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RWDD1Q9H446 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RWDD1Q9H446 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RWDD1Q9H446 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RWDD1Q9H446 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RWDD1Q9H446 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RWDD1Q9H446 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RWDD1Q9H446 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RWDD1Q9H446 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RWDD1Q9H446 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms