Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC00597Q9H2U6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00597Q9H2U6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms