Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2F9

CCDC68, Coiled-coil domain-containing protein 68, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC68Q9H2F9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC68Q9H2F9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC68Q9H2F9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms