Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA6AQ9H2E6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEMA6AQ9H2E6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SEMA6AQ9H2E6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SEMA6AQ9H2E6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SEMA6AQ9H2E6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA6AQ9H2E6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA6AQ9H2E6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms