Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF541Q9H0D2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF541Q9H0D2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF541Q9H0D2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF541Q9H0D2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF541Q9H0D2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF541Q9H0D2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF541Q9H0D2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF541Q9H0D2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF541Q9H0D2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF541Q9H0D2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF541Q9H0D2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF541Q9H0D2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF541Q9H0D2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF541Q9H0D2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF541Q9H0D2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF541Q9H0D2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF541Q9H0D2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF541Q9H0D2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF541Q9H0D2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF541Q9H0D2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF541Q9H0D2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF541Q9H0D2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF541Q9H0D2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF541Q9H0D2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF541Q9H0D2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF541Q9H0D2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF541Q9H0D2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF541Q9H0D2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF541Q9H0D2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF541Q9H0D2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF541Q9H0D2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF541Q9H0D2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZNF541Q9H0D2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF541Q9H0D2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF541Q9H0D2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF541Q9H0D2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF541Q9H0D2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF541Q9H0D2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF541Q9H0D2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF541Q9H0D2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms