Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NYXQ9GZU5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NYXQ9GZU5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms