Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
REXO4Q9GZR2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
REXO4Q9GZR2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms