Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTR3CQ9C0K3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ACTR3CQ9C0K3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms