Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
INO80BQ9C086 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
INO80BQ9C086 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms