Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM5Q9C035 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM5Q9C035 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms