Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NMES1Q9C002 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMES1Q9C002 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms